En el Dirge of Cerberus se da la opción de personalizar las armas añadiéndoles accesorios, materias y cañones diferentes, así como actualizar las pistolas a una nueva versión Con ello se consigue mejorar las prestaciones y la potencia de las armas.

Las armas tienen 5 ranuras en las que podrás insertar distintos accesorios que harán que los atributos del arma cambien. Si seleccionas una ranura, se mostrarán los componentes que puedes utilzar. Puedes guardar hasta 3 combinaciones distintas de armas en el menu Personalizar [Customize]. Es obligatorio que cada una de las tres armas personalizadas tenga un armazón y un cañón. Las 5 ranuras son:

A la derecha de la pantalla también se muestra una gráfica con los atributos de las armas. Hay cuatro niveles, C (el mas bajo), B, A y S (el mejor).

Las siguientes tablas muestran las actualizaciones de las diferentes armas.

Árbol de modificaciones arma "Cerberus"